相互牵连的继承冲突
应仁之乱，又称应仁、文明之乱，是1467年开始、以京都为主要战场的内乱。细川胜元领导的东军与山名宗全领导的西军吸纳不同守护大名及其部属，使幕府上层争端发展为持续多年的战争。
畠山氏内部的政长与义就、斯波氏内部的义敏与义廉分别争夺家督，背后还牵涉家臣和地方势力。与此同时，将军足利义政先以弟弟义视为继承人，随后又有亲生子义尚出生。将军家的继承问题与有力家族之间的竞争交织，单一家庭的争位不足以概括整个冲突。
从御灵合战到全面交战
1467年正月，失势的畠山政长焚烧自邸，移兵上御灵神社一带。按日本当时历法，文正二年正月十八日，畠山义就发动进攻，政长败退。这场御灵合战通常被视为战乱发端；此时细川胜元尚未直接投入救援，后来东、西两军的全面对抗仍在形成中。
同年改元应仁后，各方继续集结兵力。日本历五月二十六日，京都上京地区发生大规模战斗。由畠山家争端引燃的局部冲突，至此扩大为细川、山名两大阵营的战争。御灵合战与五月的全面交战，是同一年中两个不同的升级节点。
城中阵地与居民避难
东军围绕室町御所，即花之御所，修筑以土垒、壕沟组成的“御构”。山名方面在其西侧形成阵地，京都的政治中心遂被不同军队控制的防御区域分割。秋季的相国寺等地战斗，又使寺院及周边街区卷入争夺。
天皇、公家、武家和部分居民进入防御区避难，有限空间内的居住与补给成为长期问题。京都市的城市史说明指出，上京遭受严重焚毁，但下京的商工业街区仍有延续。山本雅和的考古讲义汇集室町御所、相国寺和乌丸一条等地的遗构及调查图，展示这场战争对城市空间留下的具体痕迹。