从农科大学到独立大学
1918年4月1日，勅令第43号在札幌设置北海道帝国大学，并于公布当日施行。法令同时规定，既有的东北帝国大学农科大学自此改属新大学。这是今天北海道大学沿革中独立设校的一步：已经运行的农业教育、教员和设施成为新机构的基础，医学与工学的教学则逐步筹办。
同日公布的官制安排了人员承接：原农科大学及附属部门的教授、助教授、助手和书记，未另发任命书者按原官等、薪俸转入新机构。农科大学长佐藤昌介兼任总长事务负责人，至1919年4月1日才成为专任总长。组织身份先改变，随后还要增设学部、聘任教师和准备校舍。
地方倡议与医学经费
独立大学的倡议早于1918年。1916年，北海道帝国大学设立期成会重新活动，北海道厅长俵孙一、札幌区长阿部宇之八赴东京向文部大臣高田早苗陈情。增设医学还是理工学，校方和地方人士各有考虑。佐藤昌介认为当地最需要的是医科大学，而札幌区立医院可降低设立费用。
1916年9月22日，内阁决定以八年连续支出146万日元筹设医科大学，其中15万用于预科扩充，条件是不增加国库负担。预算经议会解散的延误，到1917年7月才获通过。资金原拟来自大学土地处理、地方及私人捐款；医院也由实物移交方案转为札幌区捐款。后来物价上涨、计划扩大，至1925年度创设经费累计约384万日元，最初的国库零负担设想未能维持。
参考：[1]
把教员、实验和课程组织起来
1918年官制把总长置于文部大臣监督之下，又设置会计庶务人员和学生监督职位。在分科大学层面，法定员额为专任教授27人、助教授15人、助手32人；教授负责讲座、授课及指导研究，助教授参与授课与实验。这些是编制规定，不是当年实际到岗人数的统计。植物园、农场和演习林的负责人，则由农科大学教授或助教授兼任。
农学课程也在改组中调整。1919年9月11日制定新学则后，10月14日又按文部省意见修订。原农学科的三个分部改为农学、农业经济学和农业生物学三个学科，并设置讲授深入研究及新学说的特别讲义。课程以三年所需时数统筹，允许学生选择修读，制度上的学部化因此落实到专业分工与学习安排。
招生资格与预科衔接
新大学的招生边界并未一齐开放。1918年9月18日，农科大学教授会讨论加藤セチ的申请，十九名出席者中十四人赞成，批准她作为农学第一部的“全科选科生”入学。会议接受的原则是准许女性进入选科，却不准以正科生资格入学。这份记录显示了具体的入学机会，也保留着当时的资格限制。
大学还要把预科学生引向不同专业。1920年5月12日的农学部教授会记录，预科当年预计毕业84人，部分学生尚未确定志愿。会议决定由学部长向预科三年级介绍学部概况，具体问题再向各学科主任教授询问；面对农学部100人的入学定额，又讨论补足预科缺额。招生不仅是设定名额，还涉及课程说明和学生的升学选择。
参考：[2]
医学部先设立，医院与课堂随后运行
1919年2月7日公布的勅令第13号列出北海道帝国大学的农学部和医学部，4月1日生效，医学部各学科的开设日期另由文部大臣决定。筹备早在1918年开始：东京帝国大学的青山胤通等六人与札幌区立医院的石原弘、秦勉造受聘为创立委员，规划组织、人事和设备；1919年扩大预科招生，1920年完成部分医学建筑。
附属医院于1921年4月23日获准设置，同年11月开始诊疗；医学部到1922年4月才迎来首届67名学生。首任学部长秦勉造和首任医院长有马英二分别承担教学组织与医院管理，早期临床讲座先有内科和外科。医师队伍、患者诊疗和医学生入学由此先后结合，并非设立法令一公布便已同时齐备。
工学扩充与海外筹备
工学部则进入全国高等教育扩充计划，最初便安排国库支出二百余万日元。筹备委员吉町太郎一原任九州帝国大学工学部长，参与选聘教师和设计组织。1924年5月，八名在海外研究的教授候选人在伦敦郊外与吉町会合，校史将此记作一次非正式的首次教授会议。跨校聘任和海外研究，成为新学部组建师资的具体途径。
工学部于1924年9月26日设立，1925年4月迎来首届94人，包括全科及外国人听讲生；大实验室到该年末才完工。学则设置土木、矿山、机械、电气四科的标准课程，又允许学生跨科编排修读内容。从1918年独立设校到医、工两部运作，新大学的轮廓是在土地与经费安排、预科培养、教员集结和实验设施建设中逐步形成的。
参考：[1]