秘密组织走向武装起义
十九世纪后期，菲律宾的城市、学校和印刷活动形成新的政治联系，改革者讨论代表权、教会权力与殖民治理。1892年，安德烈斯·博尼法西奥等人组织卡蒂普南，通过秘密结社、成员誓约和地方支部招募参与者。组织在1896年暴露后，殖民当局展开追捕，起义在马尼拉周边及其他地区爆发。地方队伍寻找武器、粮食和交通路线，亲属与村落网络协助传递消息。革命在不同地区推进，参与者也提出各自对政治权力和生活改变的期待。
革命政府在战争中形成
战争使地方指挥、财政和政治领导成为迫切问题。卡维特的革命力量争论领导权，1897年的特赫罗斯会议选出以埃米利奥·阿奎纳多为首的政府，随后冲突加剧，博尼法西奥遭到审判和处决。阿奎纳多的力量继续同西班牙军队作战，又在比亚克纳巴托谈判后暂时离境。停战安排、款项和流亡者的活动同地方仍在继续的抵抗相互联系。革命组织在这些转折中重新组合，军事领袖需要依靠社区供给，并同不同地方的支持者维持关系。
独立宣言后的主权争夺
1898年美国与西班牙交战，阿奎纳多返回菲律宾，革命军扩大控制范围，并于6月12日在卡维特宣布独立。代表随后在马洛洛斯讨论政府与宪法，试图把战争中的政治组织发展为共和国。同年年底的巴黎条约把菲律宾交给美国统治，革命政府争取的主权因此进入新的冲突。1899年菲律宾与美国之间爆发战争。居民在军队、地方政府和殖民力量之间应对征粮、迁移与战斗，独立宣言后的国家建设继续在外交和战争中展开。