从博洛尼亚迁来的师生
帕多瓦大学的开端通常定在1222年。编年史把这一年描述为博洛尼亚学术共同体向帕多瓦的迁移；这不意味着博洛尼亚大学永久关闭，而是部分师生离开原城，另建稳定的教学联系。学生与博洛尼亚市政当局的冲突，是理解这次迁移的重要背景。
帕多瓦原有法律教学和学者往来，因此新群体并非进入一片教育空白。十九世纪大学史家拉什达尔已反驳由皇帝腓特烈二世下令创办的说法：皇帝后来限制博洛尼亚教学的行动服务于那不勒斯，与1222年的迁移不能混同。这里的起点是人的结社与流动，并非一张已知创校敕书。
在城市中寻找课堂与住处
早期大学没有集中式校园。师生分散利用城中建筑授课和居住，住房供应直接影响外来学生能否留下。奥兰迪的研究指出，1260年帕多瓦市政规定向学生提供租赁住房，同时保留城门附近等例外，并规范租金及分期付款。
学术活动也进入宗教和城市公共空间。拉什达尔依据文献记载，1226年邦孔帕尼奥的修辞学著作曾在主教座堂宣读，听众包括民法、教会法教师及其他师生。大学的可见形态，是讲授、宣读、聚会和日常居住组成的网络，而非后来校舍的提前出现。
1228年：迁移也是谈判手段
新大学很快遭遇留住学生的问题。1228年，学生代表与韦尔切利市议定迁移条件。依拉什达尔所分析的协议，该市承诺提供五百处较好的住所，必要时再增加；租金由城方与学生方代表共同评定，并提供贷款、保障粮食供应。
协议还承诺为神学、民法、教会法、医学、逻辑和语法教师付薪，由学生领袖选任，教师不再向学生收取这项授课费用；城方另提供两名抄书人员。学生则承诺迁居并停留八年，但约文保留无法履行时的退出条件。这些是拟议条件，不能全部当作已实现的办学规模。确有一部分人迁走，帕多瓦的教学共同体却未因此消失。
参考：[1]
危机之后重建教学秩序
十三世纪中叶，埃泽利诺·达·罗马诺统治期间，大学发展受到严重冲击。近年的研究将1260年代视为制度重新稳固的关键阶段，但也提醒，大学受挫不等于全城知识活动中断。市政立法开始明确保护学生并安排教师活动。
1264年，教宗乌尔班四世认可授予教学资格的程序及帕多瓦主教的相关权力。这种认可发生在大学形成数十年之后，不能替代1222年的起源叙述。当时法律居于教学中心，语法、哲学与医学等学科也参与其中；课程共同体与授予资格的教会权力，在此逐步接合。
谁出钱，谁选择教师
办学经费逐渐成为市政与学生共同处理的事务。拉什达尔所引1260年市政规定已涉及向教师支付薪金；1273年，法学家阿库尔修斯之子切尔沃托受聘来帕多瓦，显示城市愿意投入资源争取有声望的讲师。
这种财政支持不等于学生立即失去选择权。1331年章程所呈现的安排，是由管理城市拨款的专员提名受薪教师，再由学生正式选举。与此同时，学生向教师缴纳酬金的办法仍然存在，章程甚至规范如何交付，以免公开许诺给同伴造成压力。薪资、学生缴费和任教资格，需要分别观察，不能套用现代统一学费制度。
参考：[1]
按籍贯结社的学生自治
帕多瓦沿用并调整了博洛尼亚的组织办法。来自阿尔卑斯山以北和意大利半岛的学生分别组成团体，下设按地域来源划分的同乡组织，并参与推选领袖。1331年章程显示，这些团体不仅处理仪式，也管理代表名额、内部秩序及与教师的关系。
佐尔内塔指出，新成员依出生地归入相应团体，来源无法证明时须宣誓；本地帕多瓦学生则未享有外来学生团体同等的治理参与权。所谓学生自治因此有明确边界。研究者如今依靠章程、公证记录和零散名册重建这段历史，完整入学登记已经缺失，不能把迁移协议预计容纳的人数当作某年真实在校人数。