师生迁移带来的办学机会
莱比锡大学的创办与1409年布拉格大学的分裂有关。波希米亚国王瓦茨拉夫四世颁布库特纳霍拉法令，改变大学各同乡团的表决权分配，此后部分德语教师和学生离开布拉格。迁出者并未全部到同一地点；有人进入既有大学，也有人接受弗里德里希与威廉两位统治者的支持，在莱比锡组成新的教学共同体。
这些教师带来的不只是个人学问，还有组织和办学经验。拉什达尔的大学史指出，莱比锡沿用了布拉格的同乡团架构，各团有自己的章程和议事活动。新大学因此同时包含知识人员的迁移、地方统治者的资助和既有制度的移植，不能只用一场典礼解释其形成。
特许、筹办与正式宣告
1409年9月9日，亚历山大五世在比萨颁发特许状，允许在莱比锡设立综合学府。文书回应弗里德里希与威廉的请求，提到他们已为新近来到当地的约二十名文科教师提供生活和薪给，并承诺继续支持。这说明教宗批准面对的是已经开始形成的人力和资源安排。
12月2日，地方组织条例在圣托马斯修会的食堂宣读，两位统治者及受邀教会人士、教师在场。同日推选约翰内斯·奥托·冯·明斯特贝格为首任校长，标志正式开办。但文学院早在10月已选院长，筹备与教学组织并非等到12月才突然出现。9月特许与12月正式宣告，应视为互相衔接的阶段。
两所院舍与二十份薪给
12月条例将办学落实到房屋与经费。两位统治者捐出两处房产，组成大、小两所诸侯学院，供讲授、辩论及其他学术活动使用；这些房屋获得对城市税费和若干负担的豁免。这里的学院既有居住和讲学功能，并非现代按专业划分的学院。
条例为二十名教师指定每年五百弗罗林的资助，先由统治者财政机构支付，待取得长期收入来源后再作安排。大学并不是把这笔钱平均分给所有成员：大学院设十二席，通常每个同乡团三席，年薪各三十；其中一位神学教师另增三十。小学院设八席，通常每团两席，年薪各十二。条文记录的是承诺与岗位制度，不能当作每年实际到账的结算表。
同乡团的平等与例外
大学分迈森、萨克森、巴伐利亚和波兰四个同乡团。条例规定，它们在大学议事、文科考试、收益及其他安排中地位平等。这些名称划分的是大学成员的地域组织，不能直接当作现代国籍，更不表示每名学生都具有相同治理权。
平等原则之下仍有过渡性例外。小学院初期给萨克森团四席，由迈森和波兰两团各让出一席，期限四年；是否延续，统治者保留决定权。归属边界也会引起争议。1411年文书裁定，属于迈森教区及来自统治者领地的成员应归迈森团，处理了与原布拉格波兰团成员之间的分歧。组织规则需要在实际人员关系中继续调整。
讲授、考试与通行的资格
教宗特许状允许神学、教会法与民法、医学、哲学及自由技艺的学习，列举讲授、辩论和学术仪式等活动。它同时规定，申请学位和教学资格者经相应学科教师推荐，交梅泽堡主教审查。主教应认真考察申请人的能力，不得以恶意、欺诈或无端阻难干扰程序。
获认可者取得教学许可，可以在莱比锡以及其他综合学府任教，无须重新参加同类资格审查；主教同时担任大学学监。资格的跨校效力，有助于教师流动与知识交流。不过，获准开设某学科不等于该院系已经充分运作：比恩茨的研究区分了早期文科、神学教学与1415年医学学院的开办。
保护财产，也保留外部权力
1409年12月19日，亚历山大五世再发敕书，委托梅泽堡主教及梅泽堡、瑙姆堡两座主教座堂的教长保护大学师生。文书列举房屋、土地、收益和管辖权等可能遭侵占的权益，授权他们受理请求、追索被占财产，并运用教会惩戒，必要时请求世俗权力协助。
这种保护减少了师生凡事向教廷申诉的困难，却不是现代意义的全面自治。地方条例保留统治者解释和调整制度的权力，学位又与主教的认可相连。莱比锡早期办学的持续性，正建立在教师共同体、稳定薪给、教会资格和诸侯保护彼此配合的基础上。