1895年：大稻埕的临时院舍
1895年6月，日本统治台湾之初，台湾病院在台北大稻埕创设，借用当地台湾人的房屋。军医承担诊疗，最初服务对象限于军人、军属及总督府职员。它的起点带有殖民统治与军事医疗的背景。
医院1928年的正式年报把1895年6月列为创设时间，记濱野昇为初任院长，又记同年8月军政实施后归陆军省军医部管辖。年报提供的是月份。医院的名称与主管机关在此后数年间继续调整。
改隶与迁址是不同阶段
1896年1月，医院随民政实施转归台北县管理，称台北病院；1897年5月官制改正后改称台北医院，并设基隆、沪尾分院。1898年6月再改为台湾总督直辖，撤去这两处分院。名称、主管机关和分院配置，经过了连续调整。
迁址发生在1898年7月：医院搬入城内新北门街的院舍，同时利用大稻埕千秋街旧址设置分院，开设内科、外科、眼科，主要诊治台湾人的门诊疾病。旧址诊疗至1901年10月才结束。因此，新院舍投入使用后，旧址的门诊服务仍继续了数年。
参考：[1]
分科诊疗与人员训练
早期医院把一般患者分属内、外两科。1897年3月，眼科从内科分出；1898年7月，妇产科又从外科分出，临床分工逐渐细化。这些变化需要医师之外的护理和调剂人员配合，不能只用院舍扩大解释医院的形成。
1896年9月，医院制定看护妇养成内规，招收见习生并开始讲习。1898年9月再次举办讲习时，因学员已有的知识程度不一，分为甲、乙两班，乙班另设预备教育。1897年7月，医院还依公医候补生规则开始训练公医候补生；1898年11月制定其学科与教授方法。医院由此成为诊疗之外的人员培养场所，训练安排也进入正式规章。
参考：[1]
从讲习所到正式医学校
1917年《臺灣總督府醫學校一覽》记载，1897年4月，台北病院附设医学讲习所，由院长管理，院内医员和药剂师利用公务余暇，向台湾学生教授医学与普通学科。知识传授直接依靠医院既有人员，院内人员在既有诊疗职责之外承担教学。
1899年3月31日，台湾总督府医学校官制公布；4月1日，台北医院院长山口秀高兼任教授、校长；4月16日的公告确定学校设于台北，暂借医院一部分作为校舍。该书明确记载5月1日开始授课，首届招收七十名暂准入学的学生，并承接讲习所原有十五名学生。创设官制、任命校长、安排校舍与实际授课，应分别辨认。
参考：[2]
病房、门诊与调剂的实习
正式医学校开办后的数年，学校出资把供教学的患者收住台北医院，由教师带领学生作临床讲义。教学并非只是在医院内开课，也涉及患者收治经费、教师指导及临床场所的安排。
1905年2月1日，日本赤十字社台湾支部医院开设后，医学校改以该院代作附属医院，并把其患者用于教学。三、四年级学生分组进入门诊、病室和调剂局，接受临床讲授、诊断实习与调剂实习。这段记录显示，医学教育与台北医院关系密切，而教学场所曾经转移。医学校与医疗机构的联系，既包括借用校舍，也包括在不同临床场所组织学生实习。
参考：[2]
大学附属关系与战后名称
台北帝国大学1936年增设医学部，与医院创设相隔四十余年。1938年4月1日，原台湾总督府台北医院的建筑及土地转入大学；同月制定医学部附属医院规程，将医学教授、研究和患者诊疗联系起来，并区分住院与门诊患者。这是既有医院纳入大学医学组织的阶段。
据劉鴻德的医疗史研究，1945年接收后，医院称国立台湾大学医学院第一附属医院，1947年改为国立台湾大学医学院附属医院，1950年采用国立台湾大学医学院附设医院之名。组织与名称延续经过多次改制；1895年所标记的是这一医院谱系的创设阶段。